povratna zanka

Pri evkariontih ima proteinski kompleks kohezin pomembno vlogo pri zvijanju genomske DNK tako, da izvleče DNK v zanke. Ključni element v tem procesu je protein CTCF, ki veže DNA, za katerega je bilo predlagano, da uravnava tvorbo zanke. V številki tega tedna, Jan-Michael Peeters, Sis Dekker in njihovi sodelavci Osvetlite mehanizem delovanja CTCF. Raziskovalci so vizualizirali interakcijo med posameznimi molekulami CTCF (prikazano v rožnati barvi na naslovnici) in kohezinom (modro) in vitro, pri čemer so ugotovili, da CTCF zadostuje za blokiranje iztiskanja zanke s kohezinom. Ugotovili so tudi, da CTCF ne le zavira ekstruzijo zanke na način, ki je odvisen od orientacije, ampak včasih tudi povzroči, da se zanke skrajšajo ali spremenijo smer, v kateri rastejo. Pomembno je, da je ta regulativna vloga CTCF-jeve blokiralne aktivnosti iztiskanja zanke sama regulirana z napetostjo DNK, na katero sta vezana CTCF in kohezin.

Naslovna slika: Roman Barth, Sis Decker Lab TU Delft