The Vanishing Variants: Lessons from Gamma, Iota and Mu

V začetku leta 2021 so kolumbijski znanstveniki odkrili zaskrbljujočo novo različico koronavirusa. Ta varianta, sčasoma znana kot Mu, je imela več motečih mutacij, za katere so strokovnjaki verjeli, da bi ji lahko pomagali izogniti se obrambi imunskega sistema.

V naslednjih mesecih se je Mu hitro razširil po Kolumbiji, Spodbujanje novega porasta primerov Covid-19, Do konca avgusta so jo odkrili v več desetih državah in Svetovni zdravstveni organizaciji. je bilo poimenovano “Vrsta zanimanja”.

“Mu je začel delati nekaj hrupa po vsem svetu,” je dejal Joseph Fauwer, genomski epidemiolog z Medicinskega centra Univerze v Nebraski in avtor študije. Nedavna študija o varianti,

In potem je zastalo. Danes je različica skoraj izginila.

Za vsako delto ali omikron obstaja različica gama, jota ali mu, ki poveča lokalno plovnost, vendar nikoli ne preide v globalno prevlado. Strokovnjaki pravijo, da omikron ostaja pomembna prednostna naloga javnega zdravja, vendar se je iz teh manjših rodov treba naučiti.

“Ni spodbude, da bi preprečili prilagajanje in razvoj tega virusa,” je dejal Joel Wertheim, molekularni epidemiolog na kalifornijski univerzi v San Diegu. “Če bomo videli, kako mu je šlo v preteklosti, nas bo pomagalo pripraviti na to, kar bo počel v prihodnosti.”

Bhi-Ranova študija je osvetlila vrzeli v nadzoru in napake v politiki – zagotovila je dodatne dokaze, da omejitve mednarodnih potovanj ZDA niso bile v veljavi – in kaj je virus uspešen, kar kaže, da je bila komunikacija v zgodnjih fazah pandemije pomembnejša. v primerjavi z izogibanjem imunosti.

Raziskava osvetljuje tudi, koliko je kontekst pomemben; Variante, ki na nekaterih mestih vplivajo, na drugih nikoli ne najdejo oporeka. Posledično je težko predvideti, katere vrste bodo prevladovale, zato bo potrebno obsežno spremljanje v skoraj realnem času, da ostanemo na vrhu prihodnjih oblik in patogenov.

“Veliko lahko pridobimo, če pogledamo virusno genomsko zaporedje in rečemo: ‘To je verjetno slabše od drugega’,” pravi dr. je rekel Worthheim. “Toda edini način, da zares vemo, je, da opazujemo, kako se širi, saj obstaja veliko potencialno nevarnih oblik, ki se nikoli niso uveljavile.”

Koronavirus se nenehno spreminja in večina novih oblik ni nikoli opažena ali imenovana. Toda drugi sprožijo alarm, bodisi zato, ker hitro postanejo pogostejši ali ker so njihovi genomi videti zlovešči.

Oboje je veljalo za Mu, ko se je razširil v Kolumbijo. “Vseboval je nekaj mutacij, ki so jih ljudje zelo pozorno opazovali,” je povedala Mary Petrone, genomska epidemiologinja z Univerze v Sydneyju in avtorica novega dokumenta Mu. Več mutacij v njegovem spike proteinu je bilo dokumentiranih v drugih oblikah, ki motijo ​​​​imunski sistem, vključno z beta in gama.

READ  Scientists say meteor that hit Earth in 2014 was the first recorded interstellar object - WKRC TV Cincinnati

V novi študiji, ki še ni bila objavljena v znanstveni reviji, so znanstveniki primerjali Mujeve biološke značilnosti z alfa, beta, delta, gama in matičnimi virusi. Ugotovili so, da se Mu ni razmnoževal hitreje kot katera koli druga vrsta, vendar je bila to najbolj imunsko zatiranje v skupini – bolj odporna na protitelesa kot katera koli znana različica, razen Omicron, dr. je rekel Fauwer.

Z analizo genomskih sekvenc vzorcev mu, zbranih z vsega sveta, so raziskovalci rekonstruirali razširjenost različice. Ugotovili so, da se bo Mu verjetno pojavil v Južni Ameriki sredi leta 2020. Nato so ga predvajali mesece, preden so ga odkrili.

Genomski nadzor je bil “nepopoln in nepopoln” v mnogih delih Južne Amerike, pravijo Jesse Bloom, specialist za virusno evolucijo v Centru za raziskave raka Fred Hutchinson v Seattlu. “Če bi bilo na teh območjih boljše spremljanje, bi bilo verjetno lažje hitreje oceniti, kaj Mu skrbi.”

Mu je predstavil še en izziv. Zgodilo se je, da je prišlo do vrste mutacije, znane kot mutacija s premikanjem okvirja, ki je bila redka v vzorcih koronavirusa. Takšne mutacije so bile označene kot napake, ko so znanstveniki, vključno z dr. Fauwerjem, poskušali naložiti svoje mu sekvence. GISAIDMednarodno skladišče virusnih genomov, ki se uporablja za sledenje novim različicam.

Ta zapletenost je odložila javno objavo zaporedja mu. Raziskovalci so ugotovili, da je bil, ko je bil vzorec virusa zbran pri pacientu in ko je bil javno dostopen na GISAID, vedno daljši čas za primere mu kot za primere delta.

“Genom je v bistvu ustvarjal umetne intervale spremljanja,” je dejal dr. Fauwer. “Zaradi tega, vsaj po naših izkušnjah, nismo dobivali podatkov več tednov, medtem ko bi jih običajno poskušali dobiti v nekaj dneh.”

(Sistemi nadzora kakovosti GISAID so kritični, poudarjajo raziskovalci, in skladišče je odpravilo težavo.)

Kombinirajte te intervale nadzora z Mujevo imuniteto in zdelo se je, da je različica pripravljena za letenje. Ampak to se ni zgodilo. Namesto tega se je Mu razširil iz Južne in Srednje Amerike na druge celine, vendar se ni razširil, ko je prišel tja, so ugotovili znanstveniki. “To je bil znak, da ta varianta verjetno ni bila tako primerna za severnoameriške in evropske populacije, kot smo upali,” je dejal dr. Petrone.

READ  Arecibo teleskopski kolaps Video | HYPEBEAST

To je bilo verjetno zato, ker se je Mu znašel v konkurenci s še bolj grozljivo različico: Delta. Delta ni bila tako učinkovita pri izogibanju protitelesom kot mu, vendar je bila bolj prepustna. “Torej se je sčasoma Delta razširila širše,” je dejal dr. Bloom.

Preučevanje uspešnih variant pove le polovico zgodbe. “Različice, ki niso učinkovite, so na nek način negativne kontrole,” je dejal dr. Petrone. “Povejo nam, kaj ni delovalo, in s tem pomagajo zapolniti vrzeli v znanju glede različne telesne pripravljenosti.”

Delta prekomerno izraža več imunosupresivnih oblik, razen Mu, vključno z beta, gama in lambda. Ta vzorec nakazuje, da samo imunska utaja ni zadostovala, da bi ena vrsta virusa prehitela visoko prepustno različico virusa – ali vsaj v zgodnjih fazah pandemije, ko so nekateri ljudje imeli imuniteto.

Toda cepljenja in številni valovi okužb so spremenili pokrajino imunosti. Različica, ki močno zavira imunski sistem, bi morala zdaj imeti več prednosti, so dejali znanstveniki, zato je verjetno Omicron tako uspešen.

Druga nedavna študija je pokazala, da imunosupresivne celice gama v New Yorku ponavadi delajo bolje Soseske z visoko stopnjo že obstoječe imunosti, v nekaterih primerih zato, ker so bile v prvem valu COVID-a hudo prizadete. “Ne moremo videti nove različice v praznini, ker pade v senco vseh oblik, ki so bile pred njo,” je dejal avtor študije dr. Wertheim.

Trk različnih oblik preteklosti namreč kaže, da je uspeh močno odvisen od konteksta. Na primer, New York je morda rojstni kraj različice Iota, ki je bil odkrit prvič V vzorcih virusov, zbranih novembra 2020. zdravnik. “In tako se je hitro uveljavil,” je dejal Petrone. Tudi po prihodu bolj prepustne različice alfa je Iota več mesecev ostala prevladujoča različica mesta, preden je sčasoma izginila.

Toda v Connecticutu, kjer sta se januarja 2021 pojavili tako Iota kot Alpha, so se stvari obrnile drugače. “Alpha je takoj vzletela in Iota ni imela nobenih možnosti,” je dr. je dejal Petrone, ki je vodil Študija variant v dveh regijah,

Podoben vzorec se že začenja pojavljati pri številnih Omicronovih rodovih. V Združenih državah, BA.2.12.1, podtip, ki je bil prvič identificiran v New Yorku, je vzletelMedtem ko v Južni Afriki, BA.4 in BA.5 poganjata nov razcvet,

READ  Sladkorna bolezen: Ginseng lahko znatno zniža krvni sladkor v 30 minutah po zaužitju

To je še en razlog za preučevanje variant, je dejala Sarah Otto, evolucijska biologinja z Univerze Britanske Kolumbije. Ena varianta, ki je bila slabo usklajena za določen čas in kraj, se je morda začela v drugi. Pravzaprav je morala biti Mujeva nesreča le v tem, da je bil prehitro razkrit. “Preprosto ni bilo dovolj ljudi, ki bi imeli res imuniteto za promocijo te različice,” Dr. Otto je rekel.

Toda naslednja vrsta skrbi bi lahko bil potomec imunsko zaviralnega rodu ali kaj podobnega, ki se nikoli ni popolnoma uveljavilo, je dejala.

Pogled na pretekle različice lahko zagotovi tudi vpogled v to, kaj je delovalo – ali kaj ni – pri njihovi vključitvi. Nova študija gama zagotavlja dodatne dokaze o tem prepoved mednarodnih potovanjRazličice verjetno ne bodo ustavile globalnega širjenja, vsaj takrat, ko so jih izvajale Združene države.

Gama je bila prvič identificirana v Braziliji konec leta 2020. maja tistega leta, Združene države so večini državljanov, ki niso državljani ZDA, prepovedale potovanje v državo iz Brazilije, prepoved, ki je ostala v veljavi do novembra 2021, Toda gama je bila januarja 2021 zaznana v ZDA in se je kmalu razširila na desetine držav.

Ker gama nikoli ni prevladovala po svetu, je preučevanje njenega širjenja dalo “čistejšo” sliko o učinkovitosti omejitev potovanj, Tetyana Vasilyeva, molekularna epidemiologinja na kalifornijski univerzi v San Diegu in avtorica študije, je dejala. “Ko gre za preučevanje variant, kot je, recimo, delta – nekaj, kar je povzročilo velik izbruh povsod – je včasih res težko najti vzorce, ker je tako množično in tako hitro.” je dejal. ,

V nenehnem globalnem zdravstvenem stanju, virusu, ki se hitro spreminja, obstaja razumljiv impulz, da se osredotočimo na prihodnost, je dejal dr. Fauwer. In ko se je pozornost sveta usmerila na Delto in nato na Omicron, sta se s sodelavci pogovarjala, ali naj nadaljujejo s študijem starih novic mu.

“Pomislili smo: ‘Ali zdaj koga zanima Moo? Dr Fauwer se je spomnil. “Vendar menimo, da je še vedno prostor za visokokakovostne študije, ki postavljajo vprašanja o preteklih oblikah tesnobe in poskušajo pogledati nazaj, kaj se je zgodilo.”

Mojca Andreja

Nagnjena je k apatiji. Nevidni raziskovalec. Vseživljenjski guru slanine. Potovalni odvisnik. Organizator. "

Related Posts

Dodaj odgovor

Vaš e-naslov ne bo objavljen.

Read also x